1871年7月，沙俄利用由于阿古柏入侵所导致的新疆的混乱状态，借口安稳边境秩序，派兵强占伊犁地区，屠杀中国人民，实施殖民统治。沙俄强占了伊犁，对清政府说道是开立。

清政府多次向沙俄调停交还伊犁，皆无结果。1875年，清政府要求为首左宗棠领兵转入新疆，击溃阿古柏匪帮，强化新疆的边防，然后索还伊犁。清军转入新疆后，先后攻占了乌鲁木齐等重镇和南部边疆地区。

在军事胜利的基础上，清政府再度要沙俄交还伊犁。当时沙俄明确提出必需获得中国内地的通商权利，并割据一方中国帖克斯河流域和伊犁以西的土地，才能交还伊犁。1879年，清政府派遣的琦善在沙俄威胁下，私自签定了《里瓦吉亚条约》及《陆路通商章程》。

条约名义上把伊犁交还中国，但却将伊犁南境的帖克斯河流域和西境霍尔果斯河以西的大片领土吞并给沙俄，这样，使伊犁沦为孤城。而且，这个条约还规定：将喀什噶尔及塔尔巴台两处的双方边界做到不利于沙俄的改动，以及赔偿金军费、征税贸易、新建通商线路和加设领事等。

消息传到，中国舆论大哗，争相拒绝改约，清政府一方面迫使舆论压力，另一方面深感丧权过于多，于是拒绝接受批准后这个条约。1880年，清政府驻英公使曾纪泽使臣俄国调停改约。

沙俄为了使其屈服，在中国东北和西北边境进发了大量兵力，并增调海军在中国海面示威，对曾纪泽展开外交恫吓，还再三以终止谈判、发动战争相威胁。1881年2月24日，曾纪泽在沙俄的胁迫下，签定了中俄《伊犁条约》及《改定陆路通商章程》，替换琦善签定了条约、章程。

《中俄伊犁条约》当时称之为《改定条约》，又因签下地点在彼得堡，亦称《彼得堡条约》。主要内容是：一、沙俄交还被其侵占的中国伊犁地区，而仍割下伊犁西部霍尔里斯河以西、伊犁河南北两岸的原属中国的大片领土。斋桑湖迤东一带中俄边界有不悦之处，要两国派员勘改。所有仍未另设界碑的中俄各段边界都要派员勘、铺界碑，为沙俄更进一步强占中国领土生产了依据。

二、赔款减至900万卢布（合509万两白银），缩两年内偿清。三、俄商在新疆各地贸易，改均不纳费为暂缓纳税。四、俄商不能到嘉峪关，免职到西安、汉口通商，仅许于肃州（甘肃嘉峪关市）和吐鲁番两地加设领事。

五、伊犁居民愿为移居俄国进俄籍者，皆听得其之后。这就为沙俄武力胁迫中国各族居民迁出俄境的罪行取得了根据。这个条约和《里瓦吉亚条约》比起，除赔款减少了400万卢布外，在界务和商务方面，中国都争回了一些主权。但它仍是一个俄国通过武力威胁和外交讹诈迫使清政府签定的不平等条约，相当严重地伤害了中国领土和主权的原始，给西北边委、经济发展和人民生活造成了很大的恶果。

据此，沙俄又胁迫清政府于1882-1884年议定了《伊犁界约》、《喀什噶尔界约》等五个条约，分段新的勘了中俄西段边界。沙俄通过中俄《伊犁条约》和五个勘界议定书，又并吞了中国西部七万多平方公里的领土。

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